Straż Miejska w Toruniu chętnie współpracuje z innymi służbami. Od lat na ulicach Torunia można spotkać wspólne patrole z Policją, Żandarmerią Wojskową, Strażą Leśną, czy Izbą Celno-Skarbową.
W dniu 17 lutego 2020 roku funkcjonariusze Straży Miejskiej w Toruniu i Izby Celno-Skarbowej przeprowadzili wspólną akcję dotyczącą nielegalnej sprzedaży alkoholu i papierosów. W wyniku przeprowadzonych działań ujawniono cztery miejsca ich nielegalnej sprzedaży, dwa na terenie Starego Miasta, jedno na Podgórzu i jedno na Chełmińskim Przedmieściu. Czynności wyjaśniające prowadzi Izba Celno-Skarbowa.